MONAI（Medical Open Network for AI）是針對醫(yī)療健康領(lǐng)域進(jìn)行優(yōu)化的開源框架,。即將發(fā)布的 NVIDIA Clara 應(yīng)用框架現(xiàn)已投入生產(chǎn)，用于醫(yī)療健康和生命科學(xué)領(lǐng)域的 AI 應(yīng)用,。
MONAI 于 4 月推出，現(xiàn)已被領(lǐng)先的醫(yī)療健康研究機(jī)構(gòu)采用,。它是一個基于 PyTorch 的框架,，可通過行業(yè)特定的數(shù)據(jù)處理,、高性能訓(xùn)練工作流程、先進(jìn)的可復(fù)現(xiàn)參考實(shí)現(xiàn),，使 AI 能夠用于醫(yī)療成像的開發(fā),。
作為更新版 Clara 產(chǎn)品的一部分，MONAI 將提供 20 多種預(yù)訓(xùn)練模型,，包括最近為 COVID-19 開發(fā)的模型,，以及針對 NVIDIA DGX A100 GPU 的最新訓(xùn)練優(yōu)化。該優(yōu)化可將訓(xùn)練速度提高六倍,。
麻省總醫(yī)院 Athinoula A. Martinos 生物醫(yī)學(xué)成像中心 QTIM 實(shí)驗(yàn)室主任 Jayashree Kalpathy-Cramer 博士表示：“MONAI 正在成為醫(yī)療健康領(lǐng)域的 PyTorch,，為數(shù)據(jù)科學(xué)家和臨床醫(yī)生之間更緊密的合作鋪平了道路。借助聯(lián)邦學(xué)習(xí),，MONAI 在全球范圍內(nèi)的采用促進(jìn)了全球合作,。”
MONAI 在醫(yī)療生態(tài)系統(tǒng)中被廣泛采用,。德國癌癥研究中心,、倫敦國王學(xué)院、麻省總醫(yī)院,、斯坦福大學(xué)和范德堡大學(xué)都在使用這一 AI 成像框架,。MONAI 被應(yīng)用在從行業(yè)領(lǐng)先的成像競賽,，到 9 月舉行的首個針對該框架的新手訓(xùn)練營的各個方面,。該新手訓(xùn)練營吸引了來自 40 個國家的 550 多人注冊參與，其中包括大學(xué)本科生,。
范德堡大學(xué)的 Bennett Landman 博士表示：“MONAI 已迅速成為了醫(yī)療健康領(lǐng)域首選的深度學(xué)習(xí)框架,。從研究走向生產(chǎn)的這一步，對 AI 應(yīng)用在臨床護(hù)理中的落地來說至關(guān)重要,。NVIDIA 致力于社區(qū)驅(qū)動型科學(xué)研究,，讓學(xué)術(shù)界能夠?yàn)榭捎糜谏a(chǎn)的框架做出貢獻(xiàn),。這將有助于進(jìn)一步創(chuàng)新，以構(gòu)建企業(yè)就緒型特性,?！?/p>
新特性
NVIDIA Clara 為 MONAI 社區(qū)帶來了 AI 輔助注釋、聯(lián)邦學(xué)習(xí)和生產(chǎn)部署方面的最新突破,。
其最新版本為 AI 輔助注釋帶來了變革,，使放射科醫(yī)生可使用名為 DeepGrow 3D 的新模型。借此僅需原來十分之一的點(diǎn)擊量,，就能標(biāo)記復(fù)雜的 3D CT 數(shù)據(jù),。傳統(tǒng)的按圖像或切片對器官或病變進(jìn)行分割的方法非常耗時，對于像肝臟這樣的大型器官,，最多可能需要進(jìn)行 250 次點(diǎn)擊,。而如今，用戶可以通過更少的點(diǎn)擊次數(shù)進(jìn)行分割,。
NVIDIA Clara 的 AI 輔助注釋工具和全新 DeepGrow 3D 功能可與 Fovia Ai 的 F.A.S.T. AI 注釋軟件相結(jié)合,，用于標(biāo)記訓(xùn)練數(shù)據(jù)，并協(xié)助放射科醫(yī)生讀片,。Fovia 提供 XStream HDVR SDK 套件,，可通過業(yè)界領(lǐng)先的 PACS 查看器來查看 DICOM 圖像。
要想解鎖豐富的放射學(xué)數(shù)據(jù)集,，AI 輔助注釋是關(guān)鍵,。該技術(shù)最近還被用于標(biāo)記美國國立衛(wèi)生研究院癌癥影像檔案館發(fā)布的公共 COVID-19 CT 數(shù)據(jù)集。隨后,，這一標(biāo)記數(shù)據(jù)集被用于 MICCAI 認(rèn)證的 COVID-19 肺部 CT 病變分割挑戰(zhàn)賽中,。
Clara 聯(lián)邦學(xué)習(xí)使全球 20 家醫(yī)院在近期得以開展合作研究，從而為 COVID-19 患者開發(fā)通用 AI 模型,。EXAM 模型可預(yù)測 COVID-19 患者的需氧量,，其可通過 NGC 軟件注冊表獲取，并正在紐約西奈山衛(wèi)生系統(tǒng),、巴西 Diagnósticos da America SA,、英國國立衛(wèi)生研究院劍橋生物醫(yī)學(xué)研究中心和美國國立衛(wèi)生研究院中進(jìn)行臨床驗(yàn)證評估。
斯坦福大學(xué)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué),、放射學(xué)和醫(yī)學(xué)教授 Daniel Rubin 博士表示：“MONAI 軟件框架提供了用于訓(xùn)練和評估基于圖像的深度學(xué)習(xí)模型的關(guān)鍵組件,，其開源的方式助力培育不斷壯大的社區(qū)，為聯(lián)邦學(xué)習(xí)等令人振奮的進(jìn)步做出貢獻(xiàn),?！?/p>
NVIDIA 還將 NVIDIA Clara 擴(kuò)展到數(shù)字病理學(xué)應(yīng)用。在這一領(lǐng)域，現(xiàn)有開源工具無法應(yīng)對巨大的圖像尺寸,。用于病理學(xué)早期訪問的 Clara 包含針對 AI 應(yīng)用訓(xùn)練和部署的參考管線,。
倫敦醫(yī)學(xué)成像和 AI 價(jià)值醫(yī)療中心首席技術(shù)官 Jorge Cardoso 表示：“醫(yī)療健康數(shù)據(jù)的互操作性、模型部署和臨床路徑集成是一個日益復(fù)雜并相互交織的話題,，涉及特定領(lǐng)域的專業(yè)知識,。MONAI 項(xiàng)目與 NVIDIA Clara 生態(tài)系統(tǒng)的其他部分相結(jié)合，有助于改善患者護(hù)理,，優(yōu)化醫(yī)院運(yùn)營,。”