《電子技術(shù)應用》
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科學家利用X射線對3-D蛋白質(zhì)成像

2020-04-18
來源:孜然實驗室
關(guān)鍵詞: X射線 電子顯微鏡 DOE GFP

    近日,,通訊作者說:“在結(jié)構(gòu)生物學界,,科學家們使用X射線晶體學和低溫電子顯微鏡等技術(shù)來了解蛋白質(zhì)的精確結(jié)構(gòu)并推斷其功能,但我們不了解它們在細胞中的功能,?!?NSLS-II科學家麗莎·米勒(Lisa Miller)說:“如果您正在研究一種特定的疾病,則需要知道某種蛋白質(zhì)是否在錯誤的位置起作用或根本不起作用?!?/p>

    由美國國家能源部布魯克海文國家實驗室的美國能源部(DOE)科學用戶設(shè)施辦公室國家同步加速器光源II(NSLS-II)的研究人員組成的科學家團隊展示了一種對3-D蛋白質(zhì)成像的新技術(shù),。具有納米級的分辨率。

    他們的工作發(fā)表在《美國化學學會雜志》上,,使研究人員能夠識別蛋白質(zhì)在單個細胞內(nèi)的精確位置,,從而達到細胞膜和最小的亞細胞器的分辨率。

    

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    米勒和她的同事開發(fā)的這項新技術(shù)的特點與生物學中傳統(tǒng)的熒光顯微鏡方法類似,,在這種方法中,,一種稱為綠色熒光蛋白(GFP)的分子可以與其他蛋白連接以顯示其位置。GFP暴露于紫外線或可見光時,,會發(fā)出亮綠色的熒光,,照亮細胞中其他“不可見”的蛋白質(zhì)。

    米勒說:“使用GFP,,我們可以看到一種蛋白質(zhì)是否在大小為數(shù)百納米的亞細胞結(jié)構(gòu)中,,如細胞核或細胞質(zhì)種。但是,,這種結(jié)構(gòu)像細胞膜一樣,,只有七到十納米的大小。使用GFP這樣的可見光標簽很難看到,。要看到細胞中10納米大小的結(jié)構(gòu),,您將需要使用X射線?!睘榱丝朔@一挑戰(zhàn),,NSLS-II的研究人員與麻省理工學院(MIT)和波士頓大學(BU)的科學家合作,他們開發(fā)了一種對X射線敏感的標記,,稱為鑭系元素結(jié)合標記(LBT),。LBT是非常小的蛋白質(zhì),可以與鑭系元素(如鉺和銪)緊密結(jié)合,。

    NSLS-II的主要研究人員蒂芙尼·維克多(Tiffany Victor)說:“與GFP暴露于紫外線或可見光時會發(fā)熒光的鑭不同,,鑭系元素在X射線的存在下發(fā)熒光。而且由于鑭系元素并非天然存在于細胞中,,所以當我們用X射線顯微鏡觀察時,,我們就知道了我們感興趣的蛋白質(zhì)的位置?!盢SLS-II,,MIT和BU的研究人員共同努力,將LBT技術(shù)與X射線熒光技術(shù)相結(jié)合,。米勒說:“盡管近十年來LBT已被廣泛使用,,但從未將它們用于X射線熒光研究,。”

    除了獲得更高分辨率的圖像外,,X射線熒光還可以同時提供細胞中所有微量元素(例如鈣,、鉀、鐵,、銅和鋅)的化學圖像,。在其他研究中,米勒的團隊正在研究銅等微量元素與阿爾茨海默氏病等疾病中神經(jīng)元死亡的聯(lián)系,??梢暬@些元素相對于特定蛋白質(zhì)的位置將是新發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵。除了與X射線兼容之外,,與可見光標記相比,,LBT還具有相對較小的尺寸。

    米勒說:“想象一下,,你有一個跟你身體一樣大甚至更大的尾巴附著在你身體上,。您將無法進行很多正常的活動。但是,,如果您只需要用一根小豬的尾巴四處走動,,您仍然可以奔跑,跳躍和穿過門口,。GFP就像大尾巴-可能確實阻礙了許多蛋白質(zhì)的功能,。但是這些小的鑭系元素結(jié)合標記幾乎是看不見的?!?/p>

    為了證明LBT用于以納米級分辨率對3-D蛋白質(zhì)成像的用途,,MIT和BU的研究人員標記了細菌細胞中的兩種蛋白質(zhì) - 一種胞質(zhì)蛋白質(zhì)和一種膜蛋白質(zhì)。然后,,米勒的小組在NSLS-II的硬X射線納米探針(HXN)光束線和高級光子源(APS)的Bionanoprobe光束線上研究了樣品,。

    HXN首席束線科學家Chu Yong表示:“ HXN提供了世界領(lǐng)先的X射線焦點尺寸,可縮小至約12納米,。這對于以3D分辨率對細菌細胞成像至關(guān)重要,。我們還開發(fā)了一種將細胞安裝在專門的樣品架上的新方法,以優(yōu)化測量效率,。”

    通過將HXN的無與倫比的分辨率與LBT的功能相結(jié)合,,該團隊能夠?qū)蓚€標記的蛋白質(zhì)進行成像,。可視化細胞膜蛋白證明了可以在高分辨率下觀察到LBT,,而對細胞質(zhì)蛋白成像顯示LBT也可以在細胞內(nèi)可視化,。維克多說:“在高濃度下,鑭系元素對細胞有毒,因此對我們來說,,重要的是要證明我們可以用非常低的鑭系元素濃度處理細胞,,而該濃度無毒且足以使其穿過細胞膜使我們看到想要的蛋白質(zhì)圖像?!?/p>

    如今,, 借助這項新技術(shù)的成功應用,科學家希望能夠使用LBT以10納米的分辨率成像細胞內(nèi)的其他蛋白質(zhì),。

    

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