關(guān)鍵詞: ELVIS;ECG,;醫(yī)療電子,;圖形化
近年來,隨著醫(yī)療電子行業(yè)的飛速發(fā)展,,各種醫(yī)療產(chǎn)品的更新也日新月異,,創(chuàng)新的功能、獨(dú)特的設(shè)計(jì),,不斷吸引著人們的眼球,。同時(shí),隨著商業(yè)可用技術(shù)的更新以及成本的降低,,醫(yī)療電子產(chǎn)品越來越大眾化,。不過,,市場(chǎng)的巨大潛力與廣大空間對(duì)應(yīng)帶來的是對(duì)醫(yī)療電子產(chǎn)品設(shè)計(jì)要求的不斷提高。如果期望在這個(gè)行業(yè)占有一席之地,,創(chuàng)新的應(yīng)用,、獨(dú)特的功能,以及快速的設(shè)計(jì)開發(fā)都成為不可或缺的條件,。其中尤其以最為核心的系統(tǒng)開發(fā)為主,。
醫(yī)療電子系統(tǒng)開發(fā)所面臨的困難
如何將創(chuàng)新的思想轉(zhuǎn)化為研究成果或?qū)@咳绾慰焖俚卦O(shè)計(jì)出滿足市場(chǎng)需求的產(chǎn)品,?如何在有限的時(shí)間內(nèi)完成產(chǎn)品的測(cè)試,,縮短上市時(shí)間?這些問題都成為醫(yī)療電子行業(yè)工程師所面臨的巨大挑戰(zhàn),。而且,,挑戰(zhàn)不僅僅來自市場(chǎng)的需求,更主要的是,,醫(yī)療電子系統(tǒng)的開發(fā)涉及眾多學(xué)科與研究領(lǐng)域,,例如測(cè)試測(cè)量、電子電路,、計(jì)算編程,、信號(hào)處理、光學(xué)或圖像處理,、機(jī)械電子等,其獨(dú)特的跨領(lǐng)域特性意味著工程師在開發(fā)過程中需跨越多個(gè)開發(fā)平臺(tái),,從而完成項(xiàng)目設(shè)計(jì)中的不同階段,,并且在各部分完成獨(dú)立開發(fā)之后,再做一定的整合與集成,。而各個(gè)開發(fā)階段有不同的任務(wù)與需求,。例如,醫(yī)電信號(hào)的采集工作需要設(shè)計(jì)針對(duì)醫(yī)電傳感器的采集電路,;需要設(shè)計(jì)硬件調(diào)理電路以增強(qiáng)有用信號(hào),;軟件開發(fā)過程中則需要考慮數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換以滿足設(shè)計(jì)平臺(tái)的要求;在核心算法開發(fā)與仿真中,,需要調(diào)用大量的信號(hào)處理和數(shù)學(xué)方面的算法,;最后,則是算法的硬件實(shí)現(xiàn),。復(fù)雜的醫(yī)學(xué)電子系統(tǒng)開發(fā)過程不僅對(duì)工程師提出了要求,,更對(duì)集成的設(shè)計(jì)平臺(tái)提出了挑戰(zhàn)。由于各個(gè)開發(fā)階段需要不同的設(shè)計(jì)平臺(tái),,硬件與軟件開發(fā)的集成也成為醫(yī)電系統(tǒng)設(shè)計(jì)的瓶頸,,所以醫(yī)電系統(tǒng)的設(shè)計(jì)平臺(tái)需要兼顧這兩部分的結(jié)合,,并保證有足夠的靈活性、兼容性以及強(qiáng)大的算法開發(fā)能力,。
除此之外,,由于目前醫(yī)電系統(tǒng)的復(fù)雜性日益增加,臨床應(yīng)用中對(duì)精度或魯棒性的要求也不斷提高,。因此,,在前期的系統(tǒng)設(shè)計(jì)階段就需要引入一定的真實(shí)醫(yī)電信號(hào)作為測(cè)試輸入;同時(shí),,為了滿足24 h的重癥監(jiān)護(hù)等特殊應(yīng)用需求,,設(shè)計(jì)階段還需要考慮到實(shí)時(shí)性等硬件控制的相關(guān)要求。所以,,設(shè)計(jì)平臺(tái)也需要能夠滿足但不能局限于信號(hào)的仿真,,更需要引入真實(shí)的醫(yī)電信號(hào)完成實(shí)時(shí)信號(hào)的采集、分析與處理,。
由上述可見,,醫(yī)療電子的設(shè)計(jì)過程中所需要考慮的技術(shù)問題牽涉廣泛,對(duì)設(shè)計(jì)工程師來說難度和要求也更高,。如何幫助醫(yī)電設(shè)計(jì)工程師快速上手,,更高效地實(shí)現(xiàn)生物醫(yī)電系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與開發(fā),需要一個(gè)能夠滿足各方面需要的集成化商用開發(fā)平臺(tái),。在此應(yīng)用背景下,,NI推出圖形化設(shè)計(jì)平臺(tái)幫助設(shè)計(jì)者實(shí)現(xiàn)醫(yī)療電子的設(shè)計(jì)與研究工作。
圖形化醫(yī)療電子設(shè)計(jì)平臺(tái)
做為圖形化系統(tǒng)設(shè)計(jì)的領(lǐng)導(dǎo)者,,自1986年誕生以來,,NI以及LabVIEW圖形化開發(fā)平臺(tái)始終致力于簡(jiǎn)化編程的復(fù)雜性,在所有涉及到數(shù)據(jù)采集,、控制與設(shè)計(jì)的領(lǐng)域里,,LabVIEW圖形化編程方式已經(jīng)成為標(biāo)準(zhǔn)的開發(fā)工具。對(duì)于醫(yī)療電子設(shè)備的開發(fā)團(tuán)隊(duì)而言,,借助NI硬件平臺(tái)不僅可以連接各類醫(yī)電傳感器,,快速實(shí)現(xiàn)醫(yī)電信號(hào)的測(cè)量,還可以實(shí)現(xiàn)自定義的前端電路開發(fā),,包括板級(jí)電路或者是可編程的硬件邏輯電路,。另外,結(jié)合開放的LabVIEW編程平臺(tái),,后端的信號(hào)處理算法的開發(fā)也可以通過圖形化的開發(fā)方式實(shí)現(xiàn),,并通過NI軟硬件的無縫結(jié)合,將算法快速部署至硬件平臺(tái),。
對(duì)于前端醫(yī)電系統(tǒng)的設(shè)計(jì)而言,,自定義的板級(jí)電路設(shè)計(jì)往往是主要部分,,通常用于一些采集后的前端調(diào)理等。這些調(diào)理電路的設(shè)計(jì),,可以通過專業(yè)的電子電路設(shè)計(jì)與仿真平臺(tái)——NI ELVIS實(shí)現(xiàn),。ELVIS集成了12種精密儀器功能,包括數(shù)字萬用表,、阻抗分析,、波形發(fā)生器、示波器,、可變電源等,,醫(yī)療電子的設(shè)計(jì)工程師可以方便地調(diào)用這些集成設(shè)備,自行搭建醫(yī)療電子系統(tǒng),,開發(fā)自定義的硬件電路系統(tǒng),。例如醫(yī)電信號(hào)采集系統(tǒng),可以借助其五位半隔離數(shù)字萬用表功能來實(shí)現(xiàn),。又或者是前置放大,、濾波、隔離等較復(fù)雜的前端調(diào)理電路系統(tǒng),,也可以在ELVIS開放的電路板上借助NI Multisim電路設(shè)計(jì)軟件完成,, Multisim除了具備板級(jí)電路設(shè)計(jì)、硬件電路仿真功能外,,還可以方便地與ELVIS相集成,,直接控制ELVIS上的各種儀器功能,使得硬件電路的搭建,、設(shè)計(jì),、仿真過程效率更高。
目前,,除自定義的板級(jí)電路設(shè)計(jì)以外,基于FPGA的可編程邏輯電路在醫(yī)電系統(tǒng)設(shè)計(jì)中的應(yīng)用也越來越廣泛,。FPGA具備硬件電路的高速處理性能以及軟件系統(tǒng)的可編程靈活性,,特別適用于需要實(shí)時(shí)采集并分析的重癥監(jiān)護(hù)等情況。為了方便工程師進(jìn)行FPGA系統(tǒng)的開發(fā),,NI提出了創(chuàng)新的LabVIEW FPGA技術(shù)與CompactRIO硬件平臺(tái),,無需VHDL的經(jīng)驗(yàn),生物醫(yī)學(xué)工程師可使用圖形化編程方式,,直接參與到編程工作中,,快速實(shí)現(xiàn)醫(yī)電系統(tǒng)從設(shè)計(jì)、仿真到原型等完整過程,。
除了多樣化的硬件平臺(tái)之外,,開放且靈活的LabVIEW軟件平臺(tái)是圖形化醫(yī)療電子設(shè)計(jì)平臺(tái)的另一大優(yōu)勢(shì),。LabVIEW提供了高效的編程方式,不僅將硬件I/O引入算法設(shè)計(jì),,直接調(diào)用圖形化硬件平臺(tái)上采集的數(shù)據(jù),,而且內(nèi)置了強(qiáng)大的信號(hào)處理開發(fā)工具,實(shí)現(xiàn)高效的算法開發(fā),,還通過代碼重用,,調(diào)用成熟算法,簡(jiǎn)化構(gòu)建系統(tǒng)的復(fù)雜性,,使得設(shè)計(jì)階段的實(shí)時(shí)采集與分析成為可能,。
實(shí)時(shí)采集并使用真實(shí)醫(yī)電信號(hào)完成
醫(yī)療電子系統(tǒng)的設(shè)計(jì)
醫(yī)電信號(hào)(心電信號(hào)、血壓信號(hào),、腦電信號(hào)等)代表了一定的病理特征,,需要從中提取出病理特征參數(shù)以便于診斷。例如對(duì)于心臟病相關(guān)的診斷,,就需要從預(yù)處理后的心電數(shù)據(jù)中提取QRS波間隔,、QRS波幅度、PR間隔,、ST間隔,、胎兒心率等各種特征。這些特征可以提供關(guān)于心率,、傳導(dǎo)速度,、心臟內(nèi)各種組織狀態(tài)和各種異常情況的信息,為心臟疾病的診斷提供依據(jù),。
與其他工業(yè)應(yīng)用中激勵(lì)信號(hào)不同,,生物醫(yī)電信號(hào)很難由PC仿真出來,必須通過實(shí)際采集來獲得,。因此,,對(duì)于醫(yī)電工程師而言,真實(shí)數(shù)據(jù)源的獲取對(duì)于系統(tǒng)的設(shè)計(jì)尤為關(guān)鍵,,甚至?xí)绊懙较到y(tǒng)最終的設(shè)計(jì)效果,。這對(duì)于醫(yī)電設(shè)計(jì)平臺(tái)十分重要。一般來說,,對(duì)于實(shí)際醫(yī)學(xué)信號(hào)的獲取有2種途徑:共享數(shù)據(jù)庫與實(shí)際采集,。
與世界權(quán)威醫(yī)電數(shù)據(jù)庫的兼容
為了方便全世界的醫(yī)學(xué)工作者了解并分析典型的醫(yī)電信號(hào),麻省理工大學(xué)(MIT)與美國國家衛(wèi)生總署(NIH)都提供了權(quán)威的生物醫(yī)電數(shù)據(jù)庫,,其中存儲(chǔ)了大量不同特征的醫(yī)電信號(hào),。例如MIT數(shù)據(jù)庫中提供了相當(dāng)完整的多通道心電數(shù)據(jù),包括動(dòng)脈血壓(ABP)、中心靜脈壓(CVP),、心電圖(ECG),、呼吸(respiration)等臨床采集到的信號(hào),這其中不僅包含了正常的信號(hào),,還提供了各類病癥患者的信號(hào),,幫助科研工作者根據(jù)信號(hào)設(shè)計(jì)相關(guān)的分析算法,實(shí)現(xiàn)相應(yīng)功能,,并用于原型系統(tǒng)的測(cè)試,。
但是,由于數(shù)據(jù)庫的內(nèi)容所采用的格式并非通用的文件格式,,對(duì)于醫(yī)電工程師來說,,就需要做另外的文件轉(zhuǎn)換工作,這就為不熟悉數(shù)據(jù)格式及文件轉(zhuǎn)換的醫(yī)電工程師增加了額外的負(fù)擔(dān),。所以,,實(shí)現(xiàn)快速醫(yī)電系統(tǒng)設(shè)計(jì)開發(fā)的前提條件之一,就是開發(fā)平臺(tái)必須能夠兼容這些權(quán)威的數(shù)據(jù)庫文件,。
NI提供的生物醫(yī)電工具包提供了文件轉(zhuǎn)換的功能,,不僅可以讀取MIT的數(shù)據(jù)文件,同時(shí)也可以在不同的文件格式之間進(jìn)行轉(zhuǎn)換,,例如TDMS,、LVM、ABF數(shù)據(jù)庫以及MAT文件等,。
臨床生物醫(yī)電信號(hào)的實(shí)時(shí)采集
雖然權(quán)威數(shù)據(jù)庫提供了大量的醫(yī)電信號(hào),,但依然不能取代實(shí)際臨床數(shù)據(jù)采集。一方面,,系統(tǒng)最終需要投入實(shí)際臨床應(yīng)用,,因此,信號(hào)的實(shí)時(shí)測(cè)量是系統(tǒng)設(shè)計(jì)中的必要功能,;另一方面,,對(duì)于一些具備創(chuàng)新性和特定病理分析的系統(tǒng)而言,往往需要一些特殊的臨床信號(hào),。例如有特殊病患特征的心電信號(hào),,像心率不齊、心率變異,、早搏等,由于病癥的復(fù)雜性與多樣性,,當(dāng)數(shù)據(jù)庫無法提供的時(shí)候,,需要通過臨床采集來獲得。
除此之外,采集實(shí)際醫(yī)電信號(hào)還有另外的重要意義,。真實(shí)測(cè)量中,,信號(hào)往往伴有各種測(cè)量噪聲或電磁干擾等,所以,,噪聲消除,、信號(hào)提取等問題必須在設(shè)計(jì)階段就予以考慮。由于干擾噪聲與實(shí)際環(huán)境有關(guān),,公共數(shù)據(jù)庫無法提供,,所以必須通過實(shí)測(cè)來獲取。
以NI ELVIS平臺(tái)為例,,可以通過連接到各種第三方的醫(yī)電傳感器來獲取真實(shí)的醫(yī)電信號(hào),。例如Vernier公司的一系列生物醫(yī)電傳感器,可測(cè)量包括的血壓,、心電,、心率、呼吸等醫(yī)電信息,。在ELVIS平臺(tái)上,,還可以實(shí)現(xiàn)自定義的放大、濾波,、隔離等電路系統(tǒng),,甚至可以設(shè)計(jì)加入DSP或FPGA等芯片完成更復(fù)雜的電路設(shè)計(jì),通過采集實(shí)際的醫(yī)電信號(hào),,有針對(duì)性地實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與測(cè)試,。
例如,對(duì)于微弱的腦電或者嗅胞等神經(jīng)元信號(hào),,必須通過設(shè)計(jì)微電極放大器來進(jìn)行前置放大,。在設(shè)計(jì)放大器的過程中需要考慮阻抗匹配、放大增益以及被放大神經(jīng)信號(hào)的帶寬等以獲得非線性失真的放大,。這些信號(hào)調(diào)理電路的設(shè)計(jì)都可以在ELVIS平臺(tái)上搭建實(shí)現(xiàn),,并通過連接實(shí)際信號(hào)來進(jìn)行測(cè)試。
創(chuàng)新的算法設(shè)計(jì)之路
對(duì)于創(chuàng)新的生物醫(yī)電系統(tǒng)而言,,外圍電路的設(shè)計(jì)只是系統(tǒng)硬件設(shè)計(jì)中的一部分,,而體現(xiàn)核心價(jià)值的功能往往存在于軟件算法層面,通過開發(fā)自定義算法來實(shí)現(xiàn)特定的功能,,也就是眾所周知的IP核,。
由于生物醫(yī)電行業(yè)的發(fā)展,很多算法已經(jīng)成熟化,、公開化,。所以在某些情況下,,可以重用這些已有算法進(jìn)行進(jìn)一步開發(fā)。盡管如此,,當(dāng)算法間的開發(fā)平臺(tái)或者編程語言互不兼容時(shí),,仍然需要重寫算法并調(diào)試,反而給開發(fā)帶來一定的麻煩,。另外,,在一些大型或長期項(xiàng)目的開發(fā)過程中,也往往會(huì)遇到平臺(tái)的兼容性問題,。例如需要兼容先期所積累的開發(fā)成果,,或者不同開發(fā)小組、項(xiàng)目間代碼的互享等,。算法開發(fā)平臺(tái)的轉(zhuǎn)換,,也往往成為算法開發(fā)的瓶頸。為了應(yīng)對(duì)挑戰(zhàn),,開發(fā)平臺(tái)必須具備足夠的開放性,,以兼容不同語言平臺(tái)上的算法,完成代碼共享,。
除兼容性外,,快速自定義算法的開發(fā)與硬件調(diào)用也是自定義算法開發(fā)中不可或缺的部分。對(duì)于生物醫(yī)電工程師而言,,編程方面的技能往往不如專業(yè)的計(jì)算機(jī)工程師,。在這種情況下,如果要完成復(fù)雜系統(tǒng)及算法的開發(fā),,則需要花大量的時(shí)間學(xué)習(xí)龐大而精湛的編程技能,。同時(shí),,為了與醫(yī)學(xué)傳感器,、數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)等硬件調(diào)用相結(jié)合,更需通曉系統(tǒng)中斷,、API調(diào)用,、操作系統(tǒng)編程等更底層的編程技能,以及上萬行代碼的積累,,而對(duì)于大多數(shù)生物醫(yī)電開發(fā)工程師來說,,滿足這些要求的可能性微乎其微。所以,,這就要求生物醫(yī)電的算法開發(fā)平臺(tái)能夠提供高效的編程工具,,幫助工程師實(shí)現(xiàn)硬件的調(diào)用和程序開發(fā)。
基于LabVIEW開發(fā)的生物醫(yī)電工具包(Biomedical Startup Kit)很好地解決了算法開發(fā)的高效性,、算法的兼容性,、平臺(tái)的開放性以及軟硬件的集成性等問題,。
ELVIS或CompactRIO平臺(tái)上的采集和調(diào)理后的醫(yī)電信號(hào)可以直接被LabVIEW讀取,而無需考慮硬件API調(diào)用等底層硬件的編程難題,,使得醫(yī)電工程師能夠?qū)W⒂谒惴ǖ恼{(diào)用或者自定義算法的開發(fā),完成系統(tǒng)核心的信號(hào)分析部分,。
為了更好地幫助工程師開發(fā)生物醫(yī)電解決方案,,NI的生物醫(yī)電工具包內(nèi)建了豐富的信號(hào)采集、分析算法與圖形顯示等方法,,開發(fā)工程師可以直接調(diào)用,,甚至完成一些現(xiàn)成的生物醫(yī)電科研項(xiàng)目,例如生物醫(yī)學(xué)記錄,、在線生物信號(hào)減噪,、ECG特征提取、心率變異分析以及無創(chuàng)血壓測(cè)量分析等,。更主要的是,,借助LabVIEW開放平臺(tái)更便于在現(xiàn)成項(xiàng)目或算法的基礎(chǔ)上進(jìn)行二次開發(fā)并融入自定義的算法。目前,, NI的生物醫(yī)電工具包可以通過網(wǎng)絡(luò)免費(fèi)下載獲取,,進(jìn)一步方便了醫(yī)電工程師在開發(fā)中使用。
交互式算法開發(fā)與驗(yàn)證
以心電信號(hào)消噪為例,,心電圖(ECG)是一種記錄心臟產(chǎn)生的生物電流的技術(shù),。臨床醫(yī)生可以利用心電圖對(duì)患者的心臟狀況進(jìn)行評(píng)估,并做出進(jìn)一步診斷,。ECG傳感器可以通過電極連接人體并感知生物電流,,ECG信號(hào)可以通過ELVIS來完成采集,如圖1所示,。ECG消噪是ECG特征提取的預(yù)處理,。因?yàn)樾碾娦盘?hào)在采集過程中會(huì)被噪聲以及人為引入的偽影所污染。例如電源線干擾,、電極分離或接觸產(chǎn)生的噪聲,、病人在移動(dòng)中引入的偽影還有基線漂移等。這些噪聲和偽影也在感興趣頻段內(nèi),,往往與心電信號(hào)本身相互干擾,,從而影響到心電信號(hào)的分析和特征提取。通常,,電源線干擾可以通過采集硬件,、ELVIS或FPGA上所設(shè)計(jì)的陷波濾波器電路來完成。但基線漂移和其他寬帶噪聲通過硬件濾波器很難消除,,而軟件處理則成為設(shè)計(jì)關(guān)鍵,。
通過LabVIEW以及生物醫(yī)電工具包,,工程師可以選擇小波去趨勢(shì)、FIR濾波器等方法消除基線漂移,。具體濾波器或者小波基等參數(shù)設(shè)置將產(chǎn)生不同的消噪結(jié)果,,開放式的平臺(tái)不僅可以允許工程師自行調(diào)節(jié)參數(shù),更可以引入自定義的消噪方法,。例如對(duì)于其他寬頻干擾,,用戶除了可以使用小波方法之外,還可以嘗試自適應(yīng)濾波,、AR建模等方法,。
通過LabVIEW圖形化編程方式,工程師不僅可以利用LabVIEW中強(qiáng)大的信號(hào)處理工具箱實(shí)現(xiàn)各種分析算法,,還可以通過交互式用戶界面實(shí)現(xiàn)不同算法間的調(diào)試與比較,,以便選擇出最合適的算法。
最后,,在消除各類噪聲與偽影之后,,工程師可以開發(fā)特征提取算法。同樣地,,在生物醫(yī)電開發(fā)平臺(tái)上,,可以通過整合魯棒的提取算法或者自行開發(fā)的算法檢測(cè)ECG信號(hào)的特性,例如QRS復(fù)合,、P波形和T波形,。圖2所示為經(jīng)過小波多分辨率分析(MRA)處理完成的心電信號(hào)中的QRS群波監(jiān)測(cè)。
NI提供的圖形化生物醫(yī)電開發(fā)平臺(tái),,結(jié)合了開放的LabVIEW軟件,,無縫集成了眾多NI硬件平臺(tái)(如ELVIS、CompactRIO等),,不僅可以連接各類生物醫(yī)電傳感器,,采集各類實(shí)際的醫(yī)電信號(hào),實(shí)現(xiàn)前段調(diào)理電路的設(shè)計(jì)仿真工作,,而且可以通過LabVIEW圖形化編程平臺(tái),,調(diào)用工具包中現(xiàn)成算法,兼容第三方算法或者開發(fā)自定義的算法,。工程師或者科研人員可以在該平臺(tái)上完成從醫(yī)電信號(hào)的采集,、前置調(diào)理電路的設(shè)計(jì)、高級(jí)信號(hào)處理算法的開發(fā)與分析,、軟硬件集成測(cè)試以及最終的原型化系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)等全部生物醫(yī)電系統(tǒng)開發(fā)流程,,快速地將創(chuàng)新的思想、專利或研究成果轉(zhuǎn)化成產(chǎn)品,、并保證產(chǎn)品的可靠性和穩(wěn)定性,,從而縮短醫(yī)療電子設(shè)備的開發(fā)時(shí)間,。